2016-10-08 阅读：6998
| 序号 | 级别 | 团队名称 | 批准部门 | 批准时间 | 依托学院 |
| 1 | 国家级 | 农业生物多样性利用与保护创新团队 | 科学技术部 | 2012 | 植物保护学院 |
| 2 | 省部级 | 西南多样性区域土地优化配置与生态整治科技创新团队 | 自然资源部 | 2015 | 水利学院 |
| 3 | 省部级 | 异种器官移植供体及人类疾病模型研发技术创新团队 | 云南省人才工作领导小组办公室 | 2018 | 动物医学院 |
| 4 | 省部级 | 云南特色植物资源开发与利用创新团队 | 云南省人才工作领导小组办公室 | 2018 | 理学院 |
| 5 | 省部级 | 云南省农业生物多样性创新团队 | 云南省科学技术厅 | 2005 | 植物保护学院 |
| 6 | 省部级 | 云南省畜禽养殖与种质创新团队 | 云南省科学技术厅 | 2008 | 动物科学与技术学院 |
| 7 | 省部级 | 云南省农业昆虫与害虫防治创新团队 | 云南省科学技术厅 | 2009 | 植物保护学院 |
| 8 | 省部级 | 云南省茶因子与茶功效研究创新团队 | 云南省科学技术厅 | 2011 | 普洱茶学院 |
| 9 | 省部级 | 云南省农业入侵生物可持续控制创新团队 | 云南省科学技术厅 | 2011 | 植物保护学院 |
| 10 | 省部级 | 云南省高原山地作物可持续生产系统研究创新团队 | 云南省科学技术厅 | 2012 | 农学与生物技术学院 |
| 11 | 省部级 | 云南省土壤资源利用与保护创新团队 | 云南省科学技术厅 | 2014 | 资源与环境学院 |
| 12 | 省部级 | 云南省现代奶业创新团队 | 云南省科学技术厅 | 2016 | 动物科学与技术学院 |
| 13 | 省部级 | 云南省农田无公害生产创新团队 | 云南省科学技术厅 | 2016 | 资源与环境学院 |
| 14 | 省部级 | 云南省动物基因编辑和体细胞克隆技术创新团队 | 云南省科学技术厅 | 2017 | 动物医学院 |
| 15 | 省部级 | 云南省畜禽健康养殖与品质安全创新团队 | 云南省科学技术厅 | 2018 | 动物科学与技术学院 |
| 16 | 省部级 | 云南省药用植物合成生物学创新团队 | 云南省科学技术厅 | 2020 | 农学与生物技术学院 |
| 17 | 省部级 | 云南省林下中药材有机种植创新团队 | 云南省科学技术厅 | 2020 | 植物保护学院 |
| 18 | 省部级 | 云南农业大学兽医公共卫生省创新团队 | 云南省科学技术厅 | 2020 | 动物医学院 |
| 19 | 省部级 | 云南省食药同源功能食品创新团队 | 云南省科学技术厅 | 2022 | 食品学院 |
| 20 | 省部级 | 云南省高原畜禽消化道营养与健康创新团队 | 云南省科学技术厅 | 2022 | 动物科学院 |
| 21 | 省部级 | 云南粮食安全问题研究创新团队 | 云南省社会科学界联合会 | 2012 | 经济管理学院 |
| 22 | 省部级 | 云南高等教育面向东南亚开放研究创新团队 | 云南省社会科学界联合会 | 2013 | 国际学院 |
| 23 | 地厅级 | 云南省高校作物种质资源研究及利用科技创新团队 | 云南省教育厅 | 2010 | 农学与生物技术学院 |
| 24 | 地厅级 | 云南省高校农业资源与环境科技创新团队 | 云南省教育厅 | 2010 | 资源与环境学院 |
| 25 | 地厅级 | 云南省高校动物性食品安全与人兽共患病科技创新团队 | 云南省教育厅 | 2011 | 动物医学院 |
| 26 | 地厅级 | 云南省高校植物检疫学科技创新团队 | 云南省教育厅 | 2011 | 植物保护学院 |
| 27 | 地厅级 | 云南省高校地方猪种基因资源发掘与利用科技创新团队 | 云南省教育厅 | 2014 | 动物科学与技术学院 |
| 28 | 地厅级 | 云南省高校经济作物重要病原物致病机理与防控科技创新团队 | 云南省教育厅 | 2014 | 植物保护学院 |
| 29 | 地厅级 | 云南省高校动物基因编辑和体细胞克隆技术创新团队 | 云南省教育厅 | 2016 | 动物医学院 |
| 30 | 地厅级 | 云南省高校生猪重要疫病防控关键技术创新团队 | 云南省教育厅 | 2018 | 动物医学院 |
| 31 | 地厅级 | 云南省高校绿色食品安全快速检测科技创新团队 | 云南省教育厅 | 2018 | 食品科学技术学院 |
| 32 | 地厅级 | 云南省高校作物重大病害抗性机理与应用研究科技创新团队 | 云南省教育厅 | 2018 | 植物保护学院 |
| 33 | 地厅级 | 云南省高校高原淡水渔业科技创新团队 | 云南省教育厅 | 2019 | 动物科学与技术学院 |
| 34 | 地厅级 | 云南省高校食用菌资源保护与利用科技创新团队 | 云南省教育厅 | 2019 | 农学与生物技术学院 |
| 35 | 地厅级 | 云南省高校兰花多样性形成机理与资源利用科技创新团队 | 云南省教育厅 | 2019 | 园林园艺学院 |
| 36 | 地厅级 | 云南省高校高原山地畜禽抗逆性基因发掘与利用科技创新团队 | 云南省教育厅 | 2020 | 动物科学与技术学院 |
| 37 | 地厅级 | 云南省高校耕地生产障碍修复利用科技创新团队 | 云南省教育厅 | 2020 | 水利学院 |
| 38 | 地厅级 | 云南省高校植物有益内生菌功能发掘与应用科技创新团队 | 云南省教育厅 | 2020 | 植物保护学院 |
| 39 | 地厅级 | 云南省高校城乡康养科技创新团队 | 云南省教育厅 | 2020 | 体育学院 |
| 40 | 地厅级 | 云南省教育厅害虫生物防治科技创新团队 | 云南省教育厅 | 2022 | 植物保护学院 |